Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQC9

AKAP4, A-kinase anchor protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP4Q5JQC9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
AKAP4Q5JQC9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
AKAP4Q5JQC9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
AKAP4Q5JQC9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
AKAP4Q5JQC9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
AKAP4Q5JQC9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
AKAP4Q5JQC9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
AKAP4Q5JQC9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
AKAP4Q5JQC9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
AKAP4Q5JQC9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AKAP4Q5JQC9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AKAP4Q5JQC9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AKAP4Q5JQC9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
AKAP4Q5JQC9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms