Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms