Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms