Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARHGAP29Q52LW3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms