Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM259Q4ZIN3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms