Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
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