Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LONRF3Q496Y0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LONRF3Q496Y0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LONRF3Q496Y0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LONRF3Q496Y0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LONRF3Q496Y0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LONRF3Q496Y0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LONRF3Q496Y0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LONRF3Q496Y0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LONRF3Q496Y0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LONRF3Q496Y0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LONRF3Q496Y0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LONRF3Q496Y0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LONRF3Q496Y0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LONRF3Q496Y0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LONRF3Q496Y0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LONRF3Q496Y0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LONRF3Q496Y0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LONRF3Q496Y0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LONRF3Q496Y0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LONRF3Q496Y0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LONRF3Q496Y0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LONRF3Q496Y0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LONRF3Q496Y0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LONRF3Q496Y0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LONRF3Q496Y0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LONRF3Q496Y0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LONRF3Q496Y0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LONRF3Q496Y0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LONRF3Q496Y0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LONRF3Q496Y0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LONRF3Q496Y0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LONRF3Q496Y0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LONRF3Q496Y0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LONRF3Q496Y0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms