Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI83

KRTAP24-1, Keratin-associated protein 24-1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP24-1Q3LI83 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRTAP24-1Q3LI83 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRTAP24-1Q3LI83 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRTAP24-1Q3LI83 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRTAP24-1Q3LI83 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRTAP24-1Q3LI83 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRTAP24-1Q3LI83 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRTAP24-1Q3LI83 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRTAP24-1Q3LI83 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRTAP24-1Q3LI83 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRTAP24-1Q3LI83 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRTAP24-1Q3LI83 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRTAP24-1Q3LI83 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KRTAP24-1Q3LI83 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRTAP24-1Q3LI83 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRTAP24-1Q3LI83 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRTAP24-1Q3LI83 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRTAP24-1Q3LI83 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRTAP24-1Q3LI83 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRTAP24-1Q3LI83 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRTAP24-1Q3LI83 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRTAP24-1Q3LI83 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRTAP24-1Q3LI83 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRTAP24-1Q3LI83 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRTAP24-1Q3LI83 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRTAP24-1Q3LI83 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRTAP24-1Q3LI83 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRTAP24-1Q3LI83 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRTAP24-1Q3LI83 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRTAP24-1Q3LI83 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRTAP24-1Q3LI83 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRTAP24-1Q3LI83 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRTAP24-1Q3LI83 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRTAP24-1Q3LI83 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRTAP24-1Q3LI83 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRTAP24-1Q3LI83 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRTAP24-1Q3LI83 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRTAP24-1Q3LI83 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRTAP24-1Q3LI83 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KRTAP24-1Q3LI83 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms