Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD55Q3KP44 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD55Q3KP44 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms