Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EDRF1Q3B7T1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms