Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms