Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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