Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MSMPQ1L6U9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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