Protein–RNA interactions for Protein: Q1EHB4

SLC5A12, Sodium-coupled monocarboxylate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A12Q1EHB4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC5A12Q1EHB4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC5A12Q1EHB4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC5A12Q1EHB4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC5A12Q1EHB4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC5A12Q1EHB4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC5A12Q1EHB4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC5A12Q1EHB4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC5A12Q1EHB4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC5A12Q1EHB4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC5A12Q1EHB4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC5A12Q1EHB4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC5A12Q1EHB4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC5A12Q1EHB4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC5A12Q1EHB4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC5A12Q1EHB4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC5A12Q1EHB4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC5A12Q1EHB4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC5A12Q1EHB4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC5A12Q1EHB4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC5A12Q1EHB4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC5A12Q1EHB4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC5A12Q1EHB4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC5A12Q1EHB4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC5A12Q1EHB4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC5A12Q1EHB4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC5A12Q1EHB4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms