Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
COL24A1Q17RW2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
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