Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
UPP1Q16831 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms