Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ME3Q16798 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ME3Q16798 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ME3Q16798 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ME3Q16798 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ME3Q16798 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ME3Q16798 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ME3Q16798 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ME3Q16798 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ME3Q16798 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ME3Q16798 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ME3Q16798 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ME3Q16798 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ME3Q16798 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ME3Q16798 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ME3Q16798 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ME3Q16798 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ME3Q16798 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ME3Q16798 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ME3Q16798 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ME3Q16798 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ME3Q16798 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ME3Q16798 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ME3Q16798 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ME3Q16798 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ME3Q16798 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ME3Q16798 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ME3Q16798 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ME3Q16798 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ME3Q16798 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ME3Q16798 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ME3Q16798 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ME3Q16798 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ME3Q16798 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ME3Q16798 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ME3Q16798 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ME3Q16798 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ME3Q16798 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ME3Q16798 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ME3Q16798 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ME3Q16798 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ME3Q16798 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ME3Q16798 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ME3Q16798 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ME3Q16798 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ME3Q16798 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ME3Q16798 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ME3Q16798 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ME3Q16798 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ME3Q16798 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ME3Q16798 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ME3Q16798 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ME3Q16798 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ME3Q16798 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ME3Q16798 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ME3Q16798 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ME3Q16798 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ME3Q16798 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ME3Q16798 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ME3Q16798 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ME3Q16798 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ME3Q16798 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ME3Q16798 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ME3Q16798 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ME3Q16798 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ME3Q16798 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ME3Q16798 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ME3Q16798 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ME3Q16798 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ME3Q16798 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ME3Q16798 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ME3Q16798 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ME3Q16798 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
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ME3Q16798 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ME3Q16798 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ME3Q16798 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ME3Q16798 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ME3Q16798 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ME3Q16798 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ME3Q16798 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ME3Q16798 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ME3Q16798 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ME3Q16798 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ME3Q16798 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ME3Q16798 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ME3Q16798 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ME3Q16798 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ME3Q16798 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ME3Q16798 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ME3Q16798 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ME3Q16798 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ME3Q16798 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ME3Q16798 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ME3Q16798 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ME3Q16798 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ME3Q16798 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ME3Q16798 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ME3Q16798 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ME3Q16798 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
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