Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FXNQ16595 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FXNQ16595 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FXNQ16595 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FXNQ16595 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FXNQ16595 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FXNQ16595 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FXNQ16595 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FXNQ16595 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FXNQ16595 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FXNQ16595 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FXNQ16595 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FXNQ16595 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FXNQ16595 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FXNQ16595 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FXNQ16595 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FXNQ16595 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FXNQ16595 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FXNQ16595 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FXNQ16595 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FXNQ16595 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FXNQ16595 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FXNQ16595 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FXNQ16595 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FXNQ16595 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FXNQ16595 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FXNQ16595 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FXNQ16595 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FXNQ16595 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FXNQ16595 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
FXNQ16595 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FXNQ16595 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FXNQ16595 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FXNQ16595 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FXNQ16595 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FXNQ16595 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FXNQ16595 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FXNQ16595 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FXNQ16595 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FXNQ16595 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FXNQ16595 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FXNQ16595 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FXNQ16595 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FXNQ16595 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FXNQ16595 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FXNQ16595 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FXNQ16595 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FXNQ16595 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FXNQ16595 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FXNQ16595 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FXNQ16595 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
FXNQ16595 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FXNQ16595 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FXNQ16595 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FXNQ16595 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FXNQ16595 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FXNQ16595 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FXNQ16595 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FXNQ16595 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FXNQ16595 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FXNQ16595 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FXNQ16595 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FXNQ16595 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FXNQ16595 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FXNQ16595 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FXNQ16595 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FXNQ16595 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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FXNQ16595 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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FXNQ16595 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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FXNQ16595 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FXNQ16595 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FXNQ16595 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FXNQ16595 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FXNQ16595 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FXNQ16595 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FXNQ16595 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FXNQ16595 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FXNQ16595 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FXNQ16595 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FXNQ16595 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FXNQ16595 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FXNQ16595 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FXNQ16595 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FXNQ16595 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FXNQ16595 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FXNQ16595 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FXNQ16595 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FXNQ16595 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FXNQ16595 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FXNQ16595 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
FXNQ16595 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FXNQ16595 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FXNQ16595 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FXNQ16595 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FXNQ16595 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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