Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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