Protein–RNA interactions for Protein: Q15459

SF3A1, Splicing factor 3A subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A1Q15459 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SF3A1Q15459 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
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