Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPAQ15257 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPAQ15257 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
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