Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PCM1Q15154 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms