Protein–RNA interactions for Protein: Q15050

RRS1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRS1Q15050 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RRS1Q15050 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RRS1Q15050 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RRS1Q15050 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RRS1Q15050 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RRS1Q15050 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RRS1Q15050 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
RRS1Q15050 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RRS1Q15050 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RRS1Q15050 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RRS1Q15050 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
RRS1Q15050 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RRS1Q15050 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RRS1Q15050 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RRS1Q15050 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RRS1Q15050 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms