Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLCA4Q14CN2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms