Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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COL19A1Q14993 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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COL19A1Q14993 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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COL19A1Q14993 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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COL19A1Q14993 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL19A1Q14993 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL19A1Q14993 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL19A1Q14993 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL19A1Q14993 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL19A1Q14993 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
COL19A1Q14993 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL19A1Q14993 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL19A1Q14993 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL19A1Q14993 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL19A1Q14993 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL19A1Q14993 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL19A1Q14993 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL19A1Q14993 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL19A1Q14993 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL19A1Q14993 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL19A1Q14993 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL19A1Q14993 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL19A1Q14993 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL19A1Q14993 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL19A1Q14993 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
COL19A1Q14993 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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