Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NBR1Q14596 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NBR1Q14596 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NBR1Q14596 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NBR1Q14596 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NBR1Q14596 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NBR1Q14596 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NBR1Q14596 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NBR1Q14596 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NBR1Q14596 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NBR1Q14596 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NBR1Q14596 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NBR1Q14596 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NBR1Q14596 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NBR1Q14596 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NBR1Q14596 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NBR1Q14596 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NBR1Q14596 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NBR1Q14596 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NBR1Q14596 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NBR1Q14596 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NBR1Q14596 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NBR1Q14596 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NBR1Q14596 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NBR1Q14596 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NBR1Q14596 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NBR1Q14596 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NBR1Q14596 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NBR1Q14596 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NBR1Q14596 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NBR1Q14596 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NBR1Q14596 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBR1Q14596 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms