Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEDD9Q14511 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NEDD9Q14511 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NEDD9Q14511 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NEDD9Q14511 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD9Q14511 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD9Q14511 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD9Q14511 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD9Q14511 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD9Q14511 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD9Q14511 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD9Q14511 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD9Q14511 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD9Q14511 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD9Q14511 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD9Q14511 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD9Q14511 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD9Q14511 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD9Q14511 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD9Q14511 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
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