Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BECN1Q14457 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
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