Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP1A4Q13733 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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