Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNA1SQ13698 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms