Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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