Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
PKD2Q13563 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
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