Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
EIF4EBP1Q13541 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EIF4EBP1Q13541 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms