Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BFSP2Q13515 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms