Protein–RNA interactions for Protein: Q13496

MTM1, Myotubularin, humanhuman

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Length 603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1Q13496 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTM1Q13496 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTM1Q13496 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTM1Q13496 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
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MTM1Q13496 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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MTM1Q13496 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTM1Q13496 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTM1Q13496 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTM1Q13496 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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MTM1Q13496 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTM1Q13496 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTM1Q13496 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTM1Q13496 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTM1Q13496 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTM1Q13496 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTM1Q13496 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTM1Q13496 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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MTM1Q13496 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTM1Q13496 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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MTM1Q13496 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTM1Q13496 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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MTM1Q13496 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTM1Q13496 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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MTM1Q13496 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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MTM1Q13496 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTM1Q13496 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTM1Q13496 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTM1Q13496 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTM1Q13496 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTM1Q13496 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTM1Q13496 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTM1Q13496 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTM1Q13496 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTM1Q13496 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTM1Q13496 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTM1Q13496 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTM1Q13496 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTM1Q13496 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTM1Q13496 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTM1Q13496 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTM1Q13496 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTM1Q13496 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
MTM1Q13496 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTM1Q13496 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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