Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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FOXE3Q13461 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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FOXE3Q13461 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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FOXE3Q13461 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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FOXE3Q13461 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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FOXE3Q13461 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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FOXE3Q13461 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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FOXE3Q13461 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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FOXE3Q13461 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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FOXE3Q13461 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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