Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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