Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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