Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF5Q13243 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
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