Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
STX4Q12846 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
STX4Q12846 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
STX4Q12846 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
STX4Q12846 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
STX4Q12846 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
STX4Q12846 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
STX4Q12846 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
STX4Q12846 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
STX4Q12846 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
STX4Q12846 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
STX4Q12846 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
STX4Q12846 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
STX4Q12846 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
STX4Q12846 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
STX4Q12846 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
STX4Q12846 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
STX4Q12846 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
STX4Q12846 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
STX4Q12846 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
STX4Q12846 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
STX4Q12846 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
STX4Q12846 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
STX4Q12846 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
STX4Q12846 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
STX4Q12846 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
STX4Q12846 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
STX4Q12846 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
STX4Q12846 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
STX4Q12846 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
STX4Q12846 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
STX4Q12846 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
STX4Q12846 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
STX4Q12846 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
STX4Q12846 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
STX4Q12846 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
STX4Q12846 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
STX4Q12846 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
STX4Q12846 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
STX4Q12846 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
STX4Q12846 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
STX4Q12846 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
STX4Q12846 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
STX4Q12846 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
STX4Q12846 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
STX4Q12846 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
STX4Q12846 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
STX4Q12846 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
STX4Q12846 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
STX4Q12846 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
STX4Q12846 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
STX4Q12846 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
STX4Q12846 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
STX4Q12846 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
STX4Q12846 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
STX4Q12846 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
STX4Q12846 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
STX4Q12846 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
STX4Q12846 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
STX4Q12846 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
STX4Q12846 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
STX4Q12846 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
STX4Q12846 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
STX4Q12846 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
STX4Q12846 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
STX4Q12846 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
STX4Q12846 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
STX4Q12846 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
STX4Q12846 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
STX4Q12846 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
STX4Q12846 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
STX4Q12846 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
STX4Q12846 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
STX4Q12846 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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STX4Q12846 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
STX4Q12846 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
STX4Q12846 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
STX4Q12846 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
STX4Q12846 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
STX4Q12846 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
STX4Q12846 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
STX4Q12846 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
STX4Q12846 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
STX4Q12846 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
STX4Q12846 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
STX4Q12846 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
STX4Q12846 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
STX4Q12846 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
STX4Q12846 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
STX4Q12846 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
STX4Q12846 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
STX4Q12846 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
STX4Q12846 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
STX4Q12846 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
STX4Q12846 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
STX4Q12846 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
STX4Q12846 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
STX4Q12846 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
STX4Q12846 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms