Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FOXO1Q12778 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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