Protein–RNA interactions for Protein: Q12276

HER1, HMG2-induced ER-remodeling protein 1, yeastyeast

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Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HER1Q12276 snR43snR43 209 nt2.41□□□□□ -2.02
HER1Q12276 YPL150WYPL150W 2706 nt2.41□□□□□ -2.02
HER1Q12276 AIM9YER080W 1884 nt2.41□□□□□ -2.02
HER1Q12276 HTL1YCR020W-B 237 nt2.4□□□□□ -2.03
HER1Q12276 YER121WYER121W 345 nt2.4□□□□□ -2.03
HER1Q12276 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.4□□□□□ -2.03
HER1Q12276 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.4□□□□□ -2.03
HER1Q12276 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.4□□□□□ -2.03
HER1Q12276 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.4□□□□□ -2.03
HER1Q12276 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.4□□□□□ -2.03
HER1Q12276 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.4□□□□□ -2.03
HER1Q12276 RPL40AYIL148W 387 nt2.4□□□□□ -2.03
HER1Q12276 HSK3YKL138C-A 210 nt2.4□□□□□ -2.03
HER1Q12276 TRM7YBR061C 933 nt2.4□□□□□ -2.03
HER1Q12276 PDR1YGL013C 3207 nt2.4□□□□□ -2.03
HER1Q12276 YOL098CYOL098C 3114 nt2.39□□□□□ -2.03
HER1Q12276 YGR069WYGR069W 336 nt2.39□□□□□ -2.03
HER1Q12276 YPR146CYPR146C 330 nt2.39□□□□□ -2.03
HER1Q12276 PSO2YMR137C 1986 nt2.39□□□□□ -2.03
HER1Q12276 MRP10YDL045W-A 288 nt2.38□□□□□ -2.03
HER1Q12276 CDC36YDL165W 576 nt2.38□□□□□ -2.03
HER1Q12276 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt2.38□□□□□ -2.03
HER1Q12276 TIM9YEL020W-A 264 nt2.38□□□□□ -2.03
HER1Q12276 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt2.38□□□□□ -2.03
HER1Q12276 AYR1YIL124W 894 nt2.38□□□□□ -2.03
HER1Q12276 RAM2YKL019W 951 nt2.38□□□□□ -2.03
HER1Q12276 RPL25YOL127W 429 nt2.38□□□□□ -2.03
HER1Q12276 YOR055WYOR055W 435 nt2.38□□□□□ -2.03
HER1Q12276 CBF2YGR140W 2871 nt2.38□□□□□ -2.03
HER1Q12276 INP53YOR109W 3324 nt2.37□□□□□ -2.03
HER1Q12276 ASG1YIL130W 2895 nt2.37□□□□□ -2.03
HER1Q12276 NUP100YKL068W 2880 nt2.37□□□□□ -2.03
HER1Q12276 YFH1YDL120W 525 nt2.37□□□□□ -2.03
HER1Q12276 YDL211CYDL211C 1119 nt2.37□□□□□ -2.03
HER1Q12276 ALG13YGL047W 609 nt2.37□□□□□ -2.03
HER1Q12276 YGL239CYGL239C 315 nt2.37□□□□□ -2.03
HER1Q12276 ACB1YGR037C 264 nt2.37□□□□□ -2.03
HER1Q12276 TIM13YGR181W 318 nt2.37□□□□□ -2.03
HER1Q12276 YMR324CYMR324C 243 nt2.37□□□□□ -2.03
HER1Q12276 YNL198CYNL198C 303 nt2.37□□□□□ -2.03
HER1Q12276 RPL32YBL092W 393 nt2.37□□□□□ -2.03
HER1Q12276 PAC1YOR269W 1485 nt2.36□□□□□ -2.03
HER1Q12276 PRP6YBR055C 2700 nt2.35□□□□□ -2.03
HER1Q12276 ARP7YPR034W 1434 nt2.35□□□□□ -2.03
HER1Q12276 GUP1YGL084C 1683 nt2.35□□□□□ -2.03
HER1Q12276 YDL062WYDL062W 426 nt2.35□□□□□ -2.03
HER1Q12276 PAU8YAL068C 363 nt2.35□□□□□ -2.03
HER1Q12276 HTB2YBL002W 396 nt2.35□□□□□ -2.03
HER1Q12276 PAU20YOL161C 363 nt2.35□□□□□ -2.03
HER1Q12276 YEL043WYEL043W 2871 nt2.35□□□□□ -2.03
HER1Q12276 YDR186CYDR186C 2634 nt2.34□□□□□ -2.03
HER1Q12276 YPR089WYPR089W 2667 nt2.34□□□□□ -2.03
HER1Q12276 YDR048CYDR048C 315 nt2.34□□□□□ -2.03
HER1Q12276 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt2.34□□□□□ -2.03
HER1Q12276 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt2.34□□□□□ -2.03
HER1Q12276 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt2.34□□□□□ -2.03
HER1Q12276 DAD3YBR233W-A 285 nt2.34□□□□□ -2.03
HER1Q12276 YCK3YER123W 1575 nt2.33□□□□□ -2.04
HER1Q12276 ABF2YMR072W 552 nt2.33□□□□□ -2.04
HER1Q12276 YBR197CYBR197C 654 nt2.33□□□□□ -2.04
HER1Q12276 snR49snR49 165 nt2.33□□□□□ -2.04
HER1Q12276 FKS3YMR306W 5358 nt2.32□□□□□ -2.04
HER1Q12276 NEW1YPL226W 3591 nt2.32□□□□□ -2.04
HER1Q12276 MCD1YDL003W 1701 nt2.32□□□□□ -2.04
HER1Q12276 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.32□□□□□ -2.04
HER1Q12276 YGL041CYGL041C 204 nt2.32□□□□□ -2.04
HER1Q12276 YIL102CYIL102C 306 nt2.32□□□□□ -2.04
HER1Q12276 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.32□□□□□ -2.04
HER1Q12276 SDH2YLL041C 801 nt2.32□□□□□ -2.04
HER1Q12276 YNL010WYNL010W 726 nt2.32□□□□□ -2.04
HER1Q12276 DBP6YNR038W 1890 nt2.32□□□□□ -2.04
HER1Q12276 YPR097WYPR097W 3222 nt2.32□□□□□ -2.04
HER1Q12276 PDR3YBL005W 2931 nt2.31□□□□□ -2.04
HER1Q12276 QCR7YDR529C 384 nt2.31□□□□□ -2.04
HER1Q12276 LSO2YGR169C-A 279 nt2.31□□□□□ -2.04
HER1Q12276 APQ12YIL040W 417 nt2.31□□□□□ -2.04
HER1Q12276 DIS3YOL021C 3006 nt2.31□□□□□ -2.04
HER1Q12276 VPS16YPL045W 2397 nt2.31□□□□□ -2.04
HER1Q12276 RAD61YDR014W 1944 nt2.3□□□□□ -2.04
HER1Q12276 KAR3YPR141C 2190 nt2.3□□□□□ -2.04
HER1Q12276 RPS17AYML024W 411 nt2.3□□□□□ -2.04
HER1Q12276 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt2.3□□□□□ -2.04
HER1Q12276 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt2.3□□□□□ -2.04
HER1Q12276 KSP1YHR082C 3090 nt2.3□□□□□ -2.04
HER1Q12276 NUP120YKL057C 3114 nt2.3□□□□□ -2.04
HER1Q12276 UBR1YGR184C 5853 nt2.29□□□□□ -2.04
HER1Q12276 UBP15YMR304W 3693 nt2.29□□□□□ -2.04
HER1Q12276 AFI1YOR129C 2682 nt2.29□□□□□ -2.04
HER1Q12276 STE11YLR362W 2154 nt2.29□□□□□ -2.04
HER1Q12276 HCS1YKL017C 2052 nt2.29□□□□□ -2.04
HER1Q12276 IPT1YDR072C 1584 nt2.29□□□□□ -2.04
HER1Q12276 Q0092Q0092 141 nt2.29□□□□□ -2.04
HER1Q12276 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.29□□□□□ -2.04
HER1Q12276 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.29□□□□□ -2.04
HER1Q12276 IRA2YOL081W 9240 nt2.29□□□□□ -2.04
HER1Q12276 SLN1YIL147C 3663 nt2.29□□□□□ -2.04
HER1Q12276 YEF3YLR249W 3135 nt2.28□□□□□ -2.04
HER1Q12276 SNU114YKL173W 3027 nt2.28□□□□□ -2.04
HER1Q12276 RAV1YJR033C 4074 nt2.28□□□□□ -2.04
HER1Q12276 PTP3YER075C 2787 nt2.28□□□□□ -2.04
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