Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 SWA2YDR320C 2007 nt2.35□□□□□ -2.03
PUF2Q12221 OSH6YKR003W 1347 nt2.35□□□□□ -2.03
PUF2Q12221 FAR11YNL127W 2862 nt2.35□□□□□ -2.03
PUF2Q12221 REV1YOR346W 2958 nt2.34□□□□□ -2.03 RIP-Chip
PUF2Q12221 SCD5YOR329C 2619 nt2.34□□□□□ -2.03
PUF2Q12221 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt2.34□□□□□ -2.03
PUF2Q12221 AYR1YIL124W 894 nt2.34□□□□□ -2.03
PUF2Q12221 HSK3YKL138C-A 210 nt2.34□□□□□ -2.03
PUF2Q12221 ORC2YBR060C 1863 nt2.34□□□□□ -2.03 RIP-Chip
PUF2Q12221 CSF1YLR087C 8877 nt2.33□□□□□ -2.04
PUF2Q12221 SVL3YPL032C 2478 nt2.33□□□□□ -2.04
PUF2Q12221 SAK1YER129W 3429 nt2.33□□□□□ -2.04
PUF2Q12221 HTL1YCR020W-B 237 nt2.33□□□□□ -2.04
PUF2Q12221 CSN9YDR179C 489 nt2.33□□□□□ -2.04
PUF2Q12221 YGL239CYGL239C 315 nt2.33□□□□□ -2.04
PUF2Q12221 YGR050CYGR050C 357 nt2.33□□□□□ -2.04
PUF2Q12221 YMR324CYMR324C 243 nt2.33□□□□□ -2.04
PUF2Q12221 HCH1YNL281W 462 nt2.33□□□□□ -2.04 RIP-Chip
PUF2Q12221 PHO2YDL106C 1680 nt2.33□□□□□ -2.04
PUF2Q12221 RRP12YPL012W 3687 nt2.33□□□□□ -2.04
PUF2Q12221 HOS4YIL112W 3252 nt2.32□□□□□ -2.04
PUF2Q12221 YPR089WYPR089W 2667 nt2.32□□□□□ -2.04
PUF2Q12221 PRP6YBR055C 2700 nt2.32□□□□□ -2.04
PUF2Q12221 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt2.32□□□□□ -2.04
PUF2Q12221 BLI1YKL061W 342 nt2.32□□□□□ -2.04
PUF2Q12221 LSM7YNL147W 348 nt2.32□□□□□ -2.04
PUF2Q12221 YPR099CYPR099C 357 nt2.32□□□□□ -2.04
PUF2Q12221 SIR3YLR442C 2937 nt2.32□□□□□ -2.04 RIP-Chip
PUF2Q12221 RGA2YDR379W 3030 nt2.32□□□□□ -2.04
PUF2Q12221 CLN3YAL040C 1743 nt2.31□□□□□ -2.04
PUF2Q12221 KRE33YNL132W 3171 nt2.31□□□□□ -2.04
PUF2Q12221 snR80snR80 171 nt2.31□□□□□ -2.04
PUF2Q12221 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.31□□□□□ -2.04
PUF2Q12221 TIM13YGR181W 318 nt2.31□□□□□ -2.04
PUF2Q12221 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.31□□□□□ -2.04
PUF2Q12221 RPL32YBL092W 393 nt2.31□□□□□ -2.04
PUF2Q12221 DIS3YOL021C 3006 nt2.31□□□□□ -2.04
PUF2Q12221 LYS9YNR050C 1341 nt2.31□□□□□ -2.04
PUF2Q12221 YNL018CYNL018C 1839 nt2.31□□□□□ -2.04
PUF2Q12221 KSP1YHR082C 3090 nt2.31□□□□□ -2.04 RIP-Chip
PUF2Q12221 YEF3YLR249W 3135 nt2.31□□□□□ -2.04
PUF2Q12221 HRD3YLR207W 2502 nt2.3□□□□□ -2.04
PUF2Q12221 SAP190YKR028W 3102 nt2.3□□□□□ -2.04 RIP-Chip
PUF2Q12221 YDR344CYDR344C 444 nt2.3□□□□□ -2.04
PUF2Q12221 IPT1YDR072C 1584 nt2.3□□□□□ -2.04 RIP-Chip
PUF2Q12221 PAC1YOR269W 1485 nt2.29□□□□□ -2.04
PUF2Q12221 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt2.29□□□□□ -2.04
PUF2Q12221 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt2.29□□□□□ -2.04
PUF2Q12221 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt2.29□□□□□ -2.04
PUF2Q12221 MPH1YIR002C 2982 nt2.29□□□□□ -2.04
PUF2Q12221 EDS1YBR033W 2760 nt2.29□□□□□ -2.04
PUF2Q12221 YJL070CYJL070C 2667 nt2.28□□□□□ -2.04
PUF2Q12221 QCR7YDR529C 384 nt2.28□□□□□ -2.04
PUF2Q12221 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt2.28□□□□□ -2.04
PUF2Q12221 ACB1YGR037C 264 nt2.28□□□□□ -2.04
PUF2Q12221 YGR069WYGR069W 336 nt2.28□□□□□ -2.04
PUF2Q12221 LSO2YGR169C-A 279 nt2.28□□□□□ -2.04
PUF2Q12221 ATP7YKL016C 525 nt2.28□□□□□ -2.04
PUF2Q12221 HTB2YBL002W 396 nt2.28□□□□□ -2.04
PUF2Q12221 KTI11YBL071W-A 249 nt2.28□□□□□ -2.04
PUF2Q12221 TFC3YAL001C 3483 nt2.28□□□□□ -2.04
PUF2Q12221 INP51YIL002C 2841 nt2.27□□□□□ -2.05
PUF2Q12221 UBP11YKR098C 2154 nt2.27□□□□□ -2.05
PUF2Q12221 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.27□□□□□ -2.05
PUF2Q12221 ALG13YGL047W 609 nt2.27□□□□□ -2.05
PUF2Q12221 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt2.27□□□□□ -2.05
PUF2Q12221 VPS13YLL040C 9435 nt2.27□□□□□ -2.05
PUF2Q12221 HSC82YMR186W 2118 nt2.27□□□□□ -2.05
PUF2Q12221 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.27□□□□□ -2.05
PUF2Q12221 SWR1YDR334W 4545 nt2.27□□□□□ -2.05
PUF2Q12221 YDL211CYDL211C 1119 nt2.26□□□□□ -2.05
PUF2Q12221 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.26□□□□□ -2.05
PUF2Q12221 YNL010WYNL010W 726 nt2.26□□□□□ -2.05
PUF2Q12221 YBR277CYBR277C 402 nt2.26□□□□□ -2.05
PUF2Q12221 KAR3YPR141C 2190 nt2.26□□□□□ -2.05
PUF2Q12221 NCL1YBL024W 2055 nt2.26□□□□□ -2.05
PUF2Q12221 PTC5YOR090C 1719 nt2.25□□□□□ -2.05
PUF2Q12221 MLH1YMR167W 2310 nt2.25□□□□□ -2.05
PUF2Q12221 CDC36YDL165W 576 nt2.25□□□□□ -2.05
PUF2Q12221 YDR048CYDR048C 315 nt2.25□□□□□ -2.05
PUF2Q12221 YGL024WYGL024W 336 nt2.25□□□□□ -2.05
PUF2Q12221 GRX8YLR364W 330 nt2.25□□□□□ -2.05
PUF2Q12221 VPS16YPL045W 2397 nt2.25□□□□□ -2.05
PUF2Q12221 INP53YOR109W 3324 nt2.24□□□□□ -2.05
PUF2Q12221 SNU114YKL173W 3027 nt2.24□□□□□ -2.05
PUF2Q12221 YDL062WYDL062W 426 nt2.24□□□□□ -2.05
PUF2Q12221 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt2.24□□□□□ -2.05
PUF2Q12221 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt2.24□□□□□ -2.05
PUF2Q12221 RTC6YPL183W-A 282 nt2.24□□□□□ -2.05
PUF2Q12221 UTP22YGR090W 3714 nt2.24□□□□□ -2.05
PUF2Q12221 ALK2YBL009W 2031 nt2.24□□□□□ -2.05
PUF2Q12221 DBP6YNR038W 1890 nt2.23□□□□□ -2.05
PUF2Q12221 YIL102CYIL102C 306 nt2.23□□□□□ -2.05
PUF2Q12221 DAD3YBR233W-A 285 nt2.23□□□□□ -2.05
PUF2Q12221 snR49snR49 165 nt2.23□□□□□ -2.05
PUF2Q12221 TRS130YMR218C 3309 nt2.23□□□□□ -2.05 RIP-Chip
PUF2Q12221 ARP7YPR034W 1434 nt2.23□□□□□ -2.05
PUF2Q12221 MCD1YDL003W 1701 nt2.22□□□□□ -2.05
PUF2Q12221 BFA1YJR053W 1725 nt2.22□□□□□ -2.05
PUF2Q12221 ATG11YPR049C 3537 nt2.22□□□□□ -2.05
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