Protein–RNA interactions for Protein: Q12153

SSF2, Ribosome biogenesis protein SSF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSF2Q12153 YMR050CYMR050C 5268 nt2.95□□□□□ -1.94
SSF2Q12153 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.95□□□□□ -1.94
SSF2Q12153 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.95□□□□□ -1.94
SSF2Q12153 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.95□□□□□ -1.94
SSF2Q12153 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.95□□□□□ -1.94
SSF2Q12153 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.95□□□□□ -1.94
SSF2Q12153 CDC27YBL084C 2277 nt2.95□□□□□ -1.94
SSF2Q12153 YDR239CYDR239C 2364 nt2.95□□□□□ -1.94
SSF2Q12153 GCN4YEL009C 846 nt2.95□□□□□ -1.94
SSF2Q12153 YGL069CYGL069C 465 nt2.95□□□□□ -1.94
SSF2Q12153 TMA10YLR327C 261 nt2.95□□□□□ -1.94
SSF2Q12153 CDC53YDL132W 2448 nt2.94□□□□□ -1.94
SSF2Q12153 SLH1YGR271W 5904 nt2.94□□□□□ -1.94
SSF2Q12153 YFL063WYFL063W 456 nt2.94□□□□□ -1.94
SSF2Q12153 EMC6YLL014W 327 nt2.94□□□□□ -1.94
SSF2Q12153 YOR282WYOR282W 321 nt2.94□□□□□ -1.94
SSF2Q12153 YBR224WYBR224W 516 nt2.94□□□□□ -1.94
SSF2Q12153 PAC1YOR269W 1485 nt2.94□□□□□ -1.94
SSF2Q12153 YBR184WYBR184W 1572 nt2.94□□□□□ -1.94
SSF2Q12153 TRS130YMR218C 3309 nt2.94□□□□□ -1.94
SSF2Q12153 OSW7YFR039C 1533 nt2.93□□□□□ -1.94
SSF2Q12153 MNL2YLR057W 2550 nt2.93□□□□□ -1.94
SSF2Q12153 TAR1YLR154W-C 375 nt2.93□□□□□ -1.94
SSF2Q12153 SEF1YBL066C 3447 nt2.93□□□□□ -1.94
SSF2Q12153 ESC1YMR219W 4977 nt2.93□□□□□ -1.94
SSF2Q12153 PEP3YLR148W 2757 nt2.93□□□□□ -1.94
SSF2Q12153 EDS1YBR033W 2760 nt2.93□□□□□ -1.94
SSF2Q12153 SCH9YHR205W 2475 nt2.93□□□□□ -1.94
SSF2Q12153 LYS9YNR050C 1341 nt2.93□□□□□ -1.94
SSF2Q12153 YLR149CYLR149C 2193 nt2.93□□□□□ -1.94
SSF2Q12153 ACM1YPL267W 630 nt2.92□□□□□ -1.94
SSF2Q12153 FLO11YIR019C 4104 nt2.92□□□□□ -1.94
SSF2Q12153 TMN3YER113C 2121 nt2.91□□□□□ -1.94
SSF2Q12153 PRP8YHR165C 7242 nt2.91□□□□□ -1.94
SSF2Q12153 PHS1YJL097W 654 nt2.91□□□□□ -1.94
SSF2Q12153 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.91□□□□□ -1.94
SSF2Q12153 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt2.91□□□□□ -1.94
SSF2Q12153 NUP100YKL068W 2880 nt2.9□□□□□ -1.95
SSF2Q12153 RPL35AYDL191W 363 nt2.9□□□□□ -1.95
SSF2Q12153 YDR366CYDR366C 399 nt2.9□□□□□ -1.95
SSF2Q12153 YGL149WYGL149W 306 nt2.9□□□□□ -1.95
SSF2Q12153 HTB2YBL002W 396 nt2.9□□□□□ -1.95
SSF2Q12153 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.9□□□□□ -1.95
SSF2Q12153 SRO77YBL106C 3033 nt2.9□□□□□ -1.95
SSF2Q12153 NUM1YDR150W 8247 nt2.9□□□□□ -1.95
SSF2Q12153 OSH6YKR003W 1347 nt2.9□□□□□ -1.95
SSF2Q12153 KEL2YGR238C 2649 nt2.89□□□□□ -1.95
SSF2Q12153 PEX8YGR077C 1770 nt2.89□□□□□ -1.95
SSF2Q12153 VPH1YOR270C 2523 nt2.89□□□□□ -1.95
SSF2Q12153 NAB6YML117W 3405 nt2.89□□□□□ -1.95
SSF2Q12153 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.89□□□□□ -1.95
SSF2Q12153 HHT1YBR010W 411 nt2.89□□□□□ -1.95
SSF2Q12153 GUP1YGL084C 1683 nt2.88□□□□□ -1.95
SSF2Q12153 SPO22YIL073C 2928 nt2.88□□□□□ -1.95
SSF2Q12153 CSN9YDR179C 489 nt2.88□□□□□ -1.95
SSF2Q12153 YDR209CYDR209C 414 nt2.88□□□□□ -1.95
SSF2Q12153 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.88□□□□□ -1.95
SSF2Q12153 TUS1YLR425W 3924 nt2.88□□□□□ -1.95
SSF2Q12153 YMR320WYMR320W 306 nt2.87□□□□□ -1.95
SSF2Q12153 MMS1YPR164W 4224 nt2.87□□□□□ -1.95
SSF2Q12153 PRE4YFR050C 801 nt2.86□□□□□ -1.95
SSF2Q12153 YHL041WYHL041W 450 nt2.86□□□□□ -1.95
SSF2Q12153 RPA34YJL148W 702 nt2.86□□□□□ -1.95
SSF2Q12153 DAD3YBR233W-A 285 nt2.86□□□□□ -1.95
SSF2Q12153 SGM1YJR134C 2124 nt2.86□□□□□ -1.95
SSF2Q12153 SGS1YMR190C 4344 nt2.85□□□□□ -1.95
SSF2Q12153 RIM20YOR275C 1986 nt2.85□□□□□ -1.95
SSF2Q12153 MGM1YOR211C 2646 nt2.85□□□□□ -1.95
SSF2Q12153 ZRG8YER033C 3231 nt2.85□□□□□ -1.95
SSF2Q12153 YOR055WYOR055W 435 nt2.85□□□□□ -1.95
SSF2Q12153 SAR1YPL218W 573 nt2.85□□□□□ -1.95
SSF2Q12153 ARP8YOR141C 2646 nt2.85□□□□□ -1.95
SSF2Q12153 SMC6YLR383W 3345 nt2.85□□□□□ -1.95
SSF2Q12153 PSD2YGR170W 3417 nt2.84□□□□□ -1.95
SSF2Q12153 YIL080WYIL080W 4722 nt2.84□□□□□ -1.95
SSF2Q12153 INO80YGL150C 4470 nt2.84□□□□□ -1.95
SSF2Q12153 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.84□□□□□ -1.95
SSF2Q12153 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt2.84□□□□□ -1.95
SSF2Q12153 PHO91YNR013C 2685 nt2.84□□□□□ -1.96
SSF2Q12153 SLM1YIL105C 2061 nt2.83□□□□□ -1.96
SSF2Q12153 PHO2YDL106C 1680 nt2.83□□□□□ -1.96
SSF2Q12153 HMRA2YCR096C 360 nt2.83□□□□□ -1.96
SSF2Q12153 YBL083CYBL083C 426 nt2.83□□□□□ -1.96
SSF2Q12153 EFR3YMR212C 2349 nt2.83□□□□□ -1.96
SSF2Q12153 STB4YMR019W 2850 nt2.83□□□□□ -1.96
SSF2Q12153 PDR11YIL013C 4236 nt2.82□□□□□ -1.96
SSF2Q12153 SWR1YDR334W 4545 nt2.82□□□□□ -1.96
SSF2Q12153 snR8snR8 190 nt2.82□□□□□ -1.96
SSF2Q12153 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt2.82□□□□□ -1.96
SSF2Q12153 DNF1YER166W 4716 nt2.82□□□□□ -1.96
SSF2Q12153 SET2YJL168C 2202 nt2.82□□□□□ -1.96
SSF2Q12153 VPS34YLR240W 2628 nt2.82□□□□□ -1.96
SSF2Q12153 GRR1YJR090C 3456 nt2.81□□□□□ -1.96
SSF2Q12153 VTC3YPL019C 2508 nt2.81□□□□□ -1.96
SSF2Q12153 SIR3YLR442C 2937 nt2.81□□□□□ -1.96
SSF2Q12153 HTL1YCR020W-B 237 nt2.81□□□□□ -1.96
SSF2Q12153 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt2.81□□□□□ -1.96
SSF2Q12153 YLR053CYLR053C 327 nt2.81□□□□□ -1.96
SSF2Q12153 COS111YBR203W 2775 nt2.8□□□□□ -1.96
SSF2Q12153 YDR048CYDR048C 315 nt2.8□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 56.9 ms