Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms