Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ACSM1Q08AH1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACSM1Q08AH1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACSM1Q08AH1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACSM1Q08AH1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACSM1Q08AH1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACSM1Q08AH1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACSM1Q08AH1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACSM1Q08AH1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACSM1Q08AH1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACSM1Q08AH1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACSM1Q08AH1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACSM1Q08AH1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACSM1Q08AH1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACSM1Q08AH1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACSM1Q08AH1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACSM1Q08AH1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACSM1Q08AH1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ACSM1Q08AH1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACSM1Q08AH1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACSM1Q08AH1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACSM1Q08AH1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACSM1Q08AH1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACSM1Q08AH1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACSM1Q08AH1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACSM1Q08AH1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACSM1Q08AH1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACSM1Q08AH1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACSM1Q08AH1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACSM1Q08AH1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACSM1Q08AH1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACSM1Q08AH1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACSM1Q08AH1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACSM1Q08AH1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACSM1Q08AH1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACSM1Q08AH1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACSM1Q08AH1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACSM1Q08AH1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACSM1Q08AH1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACSM1Q08AH1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACSM1Q08AH1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACSM1Q08AH1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACSM1Q08AH1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ACSM1Q08AH1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACSM1Q08AH1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACSM1Q08AH1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACSM1Q08AH1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACSM1Q08AH1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACSM1Q08AH1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACSM1Q08AH1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACSM1Q08AH1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACSM1Q08AH1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACSM1Q08AH1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACSM1Q08AH1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACSM1Q08AH1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACSM1Q08AH1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACSM1Q08AH1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ACSM1Q08AH1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ACSM1Q08AH1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ACSM1Q08AH1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACSM1Q08AH1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACSM1Q08AH1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACSM1Q08AH1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACSM1Q08AH1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACSM1Q08AH1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACSM1Q08AH1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACSM1Q08AH1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACSM1Q08AH1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACSM1Q08AH1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACSM1Q08AH1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACSM1Q08AH1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ACSM1Q08AH1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACSM1Q08AH1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACSM1Q08AH1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACSM1Q08AH1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACSM1Q08AH1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACSM1Q08AH1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACSM1Q08AH1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACSM1Q08AH1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACSM1Q08AH1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACSM1Q08AH1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACSM1Q08AH1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACSM1Q08AH1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACSM1Q08AH1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACSM1Q08AH1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACSM1Q08AH1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACSM1Q08AH1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACSM1Q08AH1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACSM1Q08AH1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACSM1Q08AH1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ACSM1Q08AH1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACSM1Q08AH1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACSM1Q08AH1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACSM1Q08AH1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACSM1Q08AH1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ACSM1Q08AH1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACSM1Q08AH1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACSM1Q08AH1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACSM1Q08AH1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ACSM1Q08AH1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms