Protein–RNA interactions for Protein: Q08646

SSP2, Sporulation-specific protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSP2Q08646 STB4YMR019W 2850 nt2.28□□□□□ -2.04
SSP2Q08646 SYH1YPL105C 2550 nt2.28□□□□□ -2.04
SSP2Q08646 HER1YOR227W 3741 nt2.27□□□□□ -2.05
SSP2Q08646 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt2.27□□□□□ -2.05
SSP2Q08646 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.27□□□□□ -2.05
SSP2Q08646 PGA1YNL158W 597 nt2.27□□□□□ -2.05
SSP2Q08646 SFB2YNL049C 2631 nt2.27□□□□□ -2.05
SSP2Q08646 HSH155YMR288W 2916 nt2.27□□□□□ -2.05
SSP2Q08646 RPH1YER169W 2391 nt2.27□□□□□ -2.05
SSP2Q08646 CAT2YML042W 2013 nt2.26□□□□□ -2.05
SSP2Q08646 RPL37BYDR500C 267 nt2.26□□□□□ -2.05
SSP2Q08646 CRG1YHR209W 876 nt2.26□□□□□ -2.05
SSP2Q08646 TMA22YJR014W 597 nt2.26□□□□□ -2.05
SSP2Q08646 ERP4YOR016C 624 nt2.26□□□□□ -2.05
SSP2Q08646 YBR224WYBR224W 516 nt2.26□□□□□ -2.05
SSP2Q08646 TOF1YNL273W 3717 nt2.26□□□□□ -2.05
SSP2Q08646 ZRG8YER033C 3231 nt2.26□□□□□ -2.05
SSP2Q08646 PEP3YLR148W 2757 nt2.26□□□□□ -2.05
SSP2Q08646 SLM1YIL105C 2061 nt2.26□□□□□ -2.05
SSP2Q08646 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt2.25□□□□□ -2.05
SSP2Q08646 YDL062WYDL062W 426 nt2.25□□□□□ -2.05
SSP2Q08646 YDR114CYDR114C 303 nt2.25□□□□□ -2.05
SSP2Q08646 RRF1YHR038W 693 nt2.25□□□□□ -2.05
SSP2Q08646 HSK3YKL138C-A 210 nt2.25□□□□□ -2.05
SSP2Q08646 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.25□□□□□ -2.05
SSP2Q08646 FYV12YOR183W 390 nt2.25□□□□□ -2.05
SSP2Q08646 VMR1YHL035C 4779 nt2.25□□□□□ -2.05
SSP2Q08646 HMRA1YCR097W 381 nt2.24□□□□□ -2.05
SSP2Q08646 YER135CYER135C 393 nt2.24□□□□□ -2.05
SSP2Q08646 EGD1YPL037C 474 nt2.24□□□□□ -2.05
SSP2Q08646 VMA9YCL005W-A 222 nt2.24□□□□□ -2.05
SSP2Q08646 YBR184WYBR184W 1572 nt2.23□□□□□ -2.05
SSP2Q08646 COS111YBR203W 2775 nt2.23□□□□□ -2.05
SSP2Q08646 LYS9YNR050C 1341 nt2.23□□□□□ -2.05
SSP2Q08646 RBK1YCR036W 1002 nt2.23□□□□□ -2.05
SSP2Q08646 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt2.23□□□□□ -2.05
SSP2Q08646 URM1YIL008W 300 nt2.23□□□□□ -2.05
SSP2Q08646 NFU1YKL040C 771 nt2.23□□□□□ -2.05
SSP2Q08646 YML084WYML084W 309 nt2.23□□□□□ -2.05
SSP2Q08646 CYB5YNL111C 363 nt2.23□□□□□ -2.05
SSP2Q08646 DOT6YER088C 2013 nt2.23□□□□□ -2.05
SSP2Q08646 TRM3YDL112W 4311 nt2.23□□□□□ -2.05
SSP2Q08646 NUP192YJL039C 5052 nt2.23□□□□□ -2.05
SSP2Q08646 BUD2YKL092C 3315 nt2.22□□□□□ -2.05
SSP2Q08646 YER087C-AYER087C-A 552 nt2.22□□□□□ -2.05
SSP2Q08646 YBL083CYBL083C 426 nt2.22□□□□□ -2.05
SSP2Q08646 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.22□□□□□ -2.05
SSP2Q08646 RGA1YOR127W 3024 nt2.21□□□□□ -2.06
SSP2Q08646 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2.21□□□□□ -2.06
SSP2Q08646 RPL27BYDR471W 411 nt2.21□□□□□ -2.06
SSP2Q08646 QCR7YDR529C 384 nt2.21□□□□□ -2.06
SSP2Q08646 AGA2YGL032C 264 nt2.21□□□□□ -2.06
SSP2Q08646 MYO4YAL029C 4416 nt2.21□□□□□ -2.06
SSP2Q08646 DIE2YGR227W 1578 nt2.2□□□□□ -2.06
SSP2Q08646 MKT1YNL085W 2493 nt2.19□□□□□ -2.06
SSP2Q08646 ATG9YDL149W 2994 nt2.19□□□□□ -2.06
SSP2Q08646 YCR043CYCR043C 384 nt2.19□□□□□ -2.06
SSP2Q08646 BTT1YDR252W 450 nt2.19□□□□□ -2.06
SSP2Q08646 YML009C-AYML009C-A 327 nt2.19□□□□□ -2.06
SSP2Q08646 SEF1YBL066C 3447 nt2.19□□□□□ -2.06
SSP2Q08646 VPS34YLR240W 2628 nt2.19□□□□□ -2.06
SSP2Q08646 YER023C-AYER023C-A 213 nt2.18□□□□□ -2.06
SSP2Q08646 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt2.18□□□□□ -2.06
SSP2Q08646 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt2.18□□□□□ -2.06
SSP2Q08646 YPL182CYPL182C 384 nt2.18□□□□□ -2.06
SSP2Q08646 YPR099CYPR099C 357 nt2.18□□□□□ -2.06
SSP2Q08646 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt2.18□□□□□ -2.06
SSP2Q08646 UBP2YOR124C 3819 nt2.17□□□□□ -2.06
SSP2Q08646 PDR8YLR266C 2106 nt2.17□□□□□ -2.06
SSP2Q08646 YDL118WYDL118W 381 nt2.17□□□□□ -2.06
SSP2Q08646 YDL152WYDL152W 366 nt2.17□□□□□ -2.06
SSP2Q08646 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt2.17□□□□□ -2.06
SSP2Q08646 YLR287CYLR287C 1068 nt2.17□□□□□ -2.06
SSP2Q08646 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt2.17□□□□□ -2.06
SSP2Q08646 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt2.17□□□□□ -2.06
SSP2Q08646 HCS1YKL017C 2052 nt2.17□□□□□ -2.06
SSP2Q08646 MGA2YIR033W 3342 nt2.16□□□□□ -2.06
SSP2Q08646 GNT1YOR320C 1476 nt2.16□□□□□ -2.06
SSP2Q08646 snR56snR56 88 nt2.16□□□□□ -2.06
SSP2Q08646 YER079WYER079W 633 nt2.16□□□□□ -2.06
SSP2Q08646 YHL037CYHL037C 402 nt2.16□□□□□ -2.06
SSP2Q08646 LEE1YPL054W 906 nt2.16□□□□□ -2.06
SSP2Q08646 CFT1YDR301W 4074 nt2.16□□□□□ -2.06
SSP2Q08646 DAS1YJL149W 1992 nt2.16□□□□□ -2.06
SSP2Q08646 TFC8YPL007C 1767 nt2.15□□□□□ -2.06
SSP2Q08646 PLC1YPL268W 2610 nt2.15□□□□□ -2.06
SSP2Q08646 TOF2YKR010C 2316 nt2.15□□□□□ -2.07
SSP2Q08646 MCD1YDL003W 1701 nt2.14□□□□□ -2.07
SSP2Q08646 PAN3YKL025C 2040 nt2.14□□□□□ -2.07
SSP2Q08646 SDH7YDR511W 402 nt2.14□□□□□ -2.07
SSP2Q08646 UBC7YMR022W 498 nt2.14□□□□□ -2.07
SSP2Q08646 YBL071CYBL071C 309 nt2.14□□□□□ -2.07
SSP2Q08646 DCP2YNL118C 2913 nt2.14□□□□□ -2.07
SSP2Q08646 YGL239CYGL239C 315 nt2.13□□□□□ -2.07
SSP2Q08646 CGI121YML036W 546 nt2.13□□□□□ -2.07
SSP2Q08646 IRR1YIL026C 3453 nt2.12□□□□□ -2.07
SSP2Q08646 CTF4YPR135W 2784 nt2.12□□□□□ -2.07
SSP2Q08646 SPO23YBR250W 1572 nt2.12□□□□□ -2.07
SSP2Q08646 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt2.12□□□□□ -2.07
SSP2Q08646 YDR157WYDR157W 402 nt2.12□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 42.8 ms