Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SPOCK1Q08629 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms