Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PDE4CQ08493 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms