Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms